Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK7P50613 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK7P50613 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK7P50613 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK7P50613 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK7P50613 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK7P50613 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK7P50613 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms