Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARRES1P49788 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARRES1P49788 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms