Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFBP49765 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFBP49765 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms