Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLK1P49759 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLK1P49759 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLK1P49759 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLK1P49759 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLK1P49759 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLK1P49759 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLK1P49759 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms