Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRIM1P49642 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRIM1P49642 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms