Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHX1P48742 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHX1P48742 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LHX1P48742 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX1P48742 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX1P48742 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX1P48742 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LHX1P48742 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LHX1P48742 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LHX1P48742 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms