Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RECQLP46063 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RECQLP46063 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RECQLP46063 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RECQLP46063 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RECQLP46063 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RECQLP46063 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms