Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA4P43694 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA4P43694 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA4P43694 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA4P43694 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms