Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIA2P42262 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms