Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJC1P36383 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJC1P36383 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJC1P36383 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJC1P36383 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms