Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXC12P31275 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms