Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID4AP29374 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID4AP29374 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms