Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP1P28562 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms