Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMO1P25800 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMO1P25800 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO1P25800 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO1P25800 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms