Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2B4P23634 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2B4P23634 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms