Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRZ1P23471 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRZ1P23471 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms