Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRDP23468 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRDP23468 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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