Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KB1P23443 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS6KB1P23443 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms