Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERBB3P21860 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB3P21860 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms