Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRHP20396 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRHP20396 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRHP20396 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRHP20396 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRHP20396 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRHP20396 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TRHP20396 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRHP20396 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TRHP20396 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRHP20396 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRHP20396 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRHP20396 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRHP20396 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRHP20396 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRHP20396 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms