Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRAP18433 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRAP18433 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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