Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB4P17483 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms