Protein–RNA interactions for Protein: P16562

CRISP2, Cysteine-rich secretory protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP2P16562 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRISP2P16562 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms