Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCFC2P16383 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms