Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT1P13805 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNT1P13805 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms