Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTN1P12814 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms