Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP2C9P11712 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP2C9P11712 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms