Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARBP10826 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARBP10826 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARBP10826 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARBP10826 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARBP10826 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARBP10826 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARBP10826 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RARBP10826 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RARBP10826 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms