Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C8orf88P0DMB2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C8orf88P0DMB2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms