Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFTA3P0C7M3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTA3P0C7M3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms