Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F13A1P00488 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F13A1P00488 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F13A1P00488 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F13A1P00488 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F13A1P00488 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms