Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCAF4O95104 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCAF4O95104 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms