Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP2O95045 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP2O95045 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP2O95045 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP2O95045 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPP2O95045 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UPP2O95045 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UPP2O95045 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UPP2O95045 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UPP2O95045 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UPP2O95045 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UPP2O95045 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms