Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD4O60885 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD4O60885 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD4O60885 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD4O60885 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
BRD4O60885 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRD4O60885 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD4O60885 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms