Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPLO60437 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPLO60437 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPLO60437 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPLO60437 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPLO60437 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPLO60437 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPLO60437 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPLO60437 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPLO60437 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPLO60437 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms