Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
KIAA0556O60303 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
KIAA0556O60303 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIAA0556O60303 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms