Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX16O60231 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX16O60231 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX16O60231 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX16O60231 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX16O60231 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms