Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNQ2O43526 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ2O43526 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms