Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF3O43395 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms