Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP290O15078 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CEP290O15078 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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