Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3EO15041 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3EO15041 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms