Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A1O14983 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A1O14983 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms