Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD8O14715 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms