Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms