Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGRNO00468 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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