Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms