Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVV-2B6SEH9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-2B6SEH9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms