Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM200CA6NKL6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms