Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms