Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM247A6NEH6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM247A6NEH6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms